Khấu trừ thuế là nội dung quan trọng giúp doanh nghiệp giảm nghĩa vụ thuế và tránh rủi ro pháp lý. Bài viết dưới đây của Tingee sẽ giúp bạn hiểu rõ điều kiện, thời hạn kê khai và quy định mới nhất theo Luật GTGT sửa đổi từ 01/7/2025.
Khái niệm về khấu trừ thuế
Khấu trừ thuế là gì?
Khấu trừ thuế là cơ chế cho phép người nộp thuế được trừ một phần hoặc toàn bộ số thuế đã nộp trước đó khỏi nghĩa vụ thuế hiện tại. Ví dụ phổ biến nhất là khấu trừ thuế GTGT đầu vào: doanh nghiệp mua hàng hóa, dịch vụ chịu thuế sẽ đưa phần thuế đó vào chi phí hợp lý và bù trừ khi tính thuế đầu ra.
Cơ chế này nhằm tránh việc đánh thuế chồng lên cùng một giá trị hàng hóa, đồng thời giảm gánh nặng thuế cho doanh nghiệp, giúp tính toán thuế chính xác và công bằng hơn.
Khấu trừ thuế GTGT là gì?
Khấu trừ VAT là quá trình doanh nghiệp dùng số thuế GTGT đã trả khi mua hàng (đầu vào) để trừ vào số thuế phải nộp khi bán hàng (đầu ra).
Công thức tính số thuế VAT phải nộp là:
Số thuế GTGT phải nộp = Thuế đầu ra – Thuế đầu vào được khấu trừ
Ví dụ: Nhập nguyên vật liệu 300 triệu (thuế đầu vào = 30 triệu); bán sản phẩm 350 triệu (thuế đầu ra = 35 triệu); vậy số thuế còn phải nộp là 5 triệu đồng
Xem thêm: Bật mí 9 trường hợp được hoàn thuế giá trị gia tăng VAT
Một số quy định về khấu trừ thuế GTGT nhà bán hàng cần nắm rõ
Điều kiện khấu trừ thuế GTGT
Theo Điều 14, Luật 48/2024/QH15, hướng dẫn cụ thể trong Nghị định 181/2025/NĐ‑CP, đầu vào muốn được khấu trừ thuế cần phải thỏa mãn các điều kiện sau:
- Có hóa đơn GTGT hợp lệ hoặc chứng từ thuế GTGT nhập khẩu/thay cho phía nước ngoài.
- Thanh toán không dùng tiền mặt nếu hóa đơn có giá trị từ 5 triệu đồng trở lên
- Nếu là hàng xuất khẩu, thêm các chứng từ gồm: hợp đồng ngoại thương, hóa đơn, tờ khai hải quan, bưu chính vận đơn, chứng từ bảo hiểm nếu có
Trong trường hợp không đáp ứng các điều kiện trên, tổng số thuế GTGT đầu vào không được khấu trừ có thể được đưa vào chi phí hợp lý hoặc nguyên giá tài sản cố định theo Luật thuế thu nhập doanh nghiệp.
Thời hạn kê khai và khấu trừ VAT
Theo Khoản 1, Điều 14, Luật GTGT 2024, thuế GTGT đầu vào phát sinh trong tháng/quý nào sẽ được kê khai, khấu trừ trong kỳ thuế tương ứng. Phần chưa khấu trừ được chuyển sang kỳ sau.
Điều khoản này cho phép doanh nghiệp định kỳ kê khai hàng tháng/quý trên Cổng thuế điện tử, đảm bảo khấu trừ đúng kỳ phát sinh và tiết kiệm tối đa số thuế phải nộp.
Cách tính số thuế GTGT phải nộp
Công thức tính đã nêu rõ ở trên. Cụ thể:
- Thuế đầu ra = Tổng thuế trên hóa đơn bán hàng.
- Thuế đầu vào được khấu trừ = Tổng thuế trên hóa đơn mua hàng nếu đủ điều kiện.
- Kết quả = Thuế phải nộp = đầu ra – đầu vào.
Ví dụ: Nếu đầu ra là 100 triệu, đầu vào là 60 triệu → phải nộp 40 triệu.
Nếu đầu vào lớn hơn đầu ra, số âm sẽ được chuyển kỳ, không được hoàn tiền ngay mà giảm nghĩa vụ kỳ sau.
Xem thêm: Cách tính thuế giá trị gia tăng cho hộ kinh doanh và doanh nghiệp
Lưu ý quan trọng về khấu trừ thuế GTGT
Việc khấu trừ VAT không chỉ phụ thuộc vào công thức tính toán mà còn chịu tác động mạnh từ các điều kiện về chứng từ, phương thức thanh toán, và thời điểm kê khai. Dưới đây là những điểm doanh nghiệp cần lưu ý để đảm bảo thực hiện đúng quy định và tránh bị loại khỏi quyền khấu trừ:
Thanh toán không dùng tiền mặt là điều kiện bắt buộc từ 1/7/2025
Theo quy định mới tại Luật Thuế GTGT sửa đổi (Luật số 48/2024/QH15) và Công văn 2111/TCT-CS ngày 20/5/2024, kể từ 01/7/2025, doanh nghiệp chỉ được khấu trừ thuế GTGT đầu vào nếu hóa đơn có giá trị từ 5 triệu đồng trở lên và được thanh toán không dùng tiền mặt.
Điều này có nghĩa là các hình thức như: chuyển khoản qua ngân hàng, ủy nhiệm chi, thanh toán QR code, ví điện tử có đối soát… đều hợp lệ. Ngược lại, thanh toán bằng tiền mặt sẽ mất quyền khấu trừ, trừ khi thuộc trường hợp ngoại lệ được pháp luật cho phép.
Hóa đơn cần mã xác thực và nội dung đầy đủ, chính xác
Doanh nghiệp chỉ được khấu trừ VAT từ hóa đơn GTGT hợp pháp, nghĩa là hóa đơn có mã của cơ quan thuế, không có dấu hiệu giả mạo và nội dung phù hợp thực tế phát sinh giao dịch. Các trường hợp hóa đơn bị ghi sai thông tin, không thể hiện rõ ràng hàng hóa/dịch vụ cung ứng, hoặc khác với hợp đồng/thanh toán thực tế đều có nguy cơ bị loại khỏi chi phí hợp lý và không được khấu trừ thuế.
Thuế GTGT đầu vào phải được hạch toán riêng
Theo hướng dẫn của chuyên gia kế toán thuế, doanh nghiệp cần hạch toán rõ ràng và riêng biệt ba loại chi phí liên quan đến thuế GTGT:
- Thuế GTGT đầu vào được khấu trừ
- Thuế GTGT đầu vào không được khấu trừ
- Thuế GTGT đầu vào không liên quan đến hoạt động kinh doanh chịu thuế
Việc hạch toán sai nhóm hoặc ghi nhận chung vào chi phí thường dẫn đến hậu quả là bị loại khi quyết toán thuế, hoặc không chứng minh được quyền khấu trừ trong trường hợp bị kiểm tra, thanh tra.
Được phép kê khai điều chỉnh nếu phát hiện sai sót trước khi bị kiểm tra
Nếu doanh nghiệp phát hiện chưa kê khai đủ số thuế GTGT đầu vào được khấu trừ trong kỳ trước, hoàn toàn có quyền kê khai bổ sung trong kỳ hiện tại, miễn là chưa bị thanh tra, kiểm tra thuế.
Tuy nhiên, việc điều chỉnh phải được thực hiện đúng theo mẫu biểu và văn bản hướng dẫn tại Thông tư 80/2021/TT-BTC, tránh gây sai lệch lớn dẫn đến nghi ngờ gian lận. Điều này giúp doanh nghiệp chủ động sửa sai, không bị xử phạt và vẫn đảm bảo quyền lợi hợp pháp về thuế.
Với hàng xuất khẩu, hóa đơn đầu vào cần đủ hồ sơ kèm theo
Đối với hoạt động xuất khẩu, để được khấu trừ và hoàn thuế GTGT đầu vào, doanh nghiệp cần cung cấp bộ hồ sơ chứng minh xuất khẩu hợp lệ bao gồm:
- Hợp đồng ngoại thương
- Tờ khai hải quan xuất khẩu
- Hóa đơn GTGT đầu vào
- Chứng từ thanh toán quốc tế
- Vận đơn, phiếu xuất kho và các giấy tờ liên quan khác
Chỉ khi đáp ứng đầy đủ bộ chứng từ, thuế GTGT đầu vào phục vụ cho hàng xuất khẩu mới được chấp nhận khấu trừ và hoàn thuế theo đúng quy định tại Điều 16, Thông tư 219/2013/TT-BTC và các văn bản sửa đổi, bổ sung.
Xem thêm: Luật thuế giá trị gia tăng VAT mới nhất cần đặc biệt lưu ý
Khấu trừ thuế GTGT giúp doanh nghiệp và hộ kinh doanh giảm nghĩa vụ thuế, minh bạch tài chính và tránh rủi ro pháp lý. Tuy nhiên, để được khấu trừ hợp lệ, bạn cần đảm bảo đầy đủ chứng từ, thanh toán không dùng tiền mặt, và kê khai đúng thời hạn.
Từ 01/7/2025, Luật Thuế GTGT sửa đổi chính thức có hiệu lực, với nhiều quy định chặt chẽ hơn về điều kiện khấu trừ. Vì vậy, việc cập nhật sớm và thực hiện đúng sẽ giúp bạn chủ động bảo vệ dòng tiền và tránh bị xử phạt không đáng có.
Tingee – Trợ lý tài chính cho nhà bán hàng và doanh nghiệp sẽ luôn đồng hành cùng bạn trong hành trình số hóa, từ việc quản lý giao dịch, kiểm soát dòng tiền đến hỗ trợ xuất hóa đơn, lưu trữ chứng từ và đảm bảo khấu trừ thuế đúng quy định. Đừng quên theo dõi Tingee nhé!
